参考:TCGA数据库ensembl id转为gene Symbol,提取出需要的RNA种类表达谱列表信息

1、打开TCGA首页,在选择 Documentation
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2、选择 Data 下的 mRNA
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3、进入 gencode :Release 36 (GRCh38.p13)
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4、选择下载文件
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5、下载内容展示(图一为Comprehensive gene annotation | ALL,图二为 lncRNA)。从文件内容中筛选出来自己所需类型的基因就ok了(图一需要筛选所需的基因类型,图二均为lncRNA无需筛选)
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但是在lncRNA文件下载的数据中,没有找到我需要的gene_name,还是需要下载全基因文件

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